São conjuntos documentais oriundos de um órgão ou de uma pessoa que os produziu e/ou acumulou durante sua existência. O Centro de Memória possui, em seu acervo, documentos referentes aos seguintes fundos:

• Geraldo Horácio de Paula Souza;
• Francisco Borges Vieira;
• Rubens Azzi Leal;
• Judith Corrêa de Carvalho;
• Maria Novaes Filha;
• Francisco Antônio Cardoso;
• Rodolfo dos Santos Mascarenhas;
• Vicente Sampaio de Lara;
• Ruy Laurenti;
• José Santos;
• Maria Antonieta de Castro;
• Nelly Candeias;
• Armando Piovesan;
• Aristides Almeida Rocha;
• José Maria Barata;
• Maria Cecília F. Pelicioni;
• Oswaldo Forattini;
• Educadoras Sanitárias e Curso de Especialização em Saúde Pública;
• José Barata;
• Fundação Rockfeller;
• Lucas Assumpção;
• John Lane;
• Arnaldo Augusto Siqueira;
• Memória Institucional da Faculdade de Saúde Pública;
• Hospital Psiquiátrico Juquery;
• José Santos;
• Rafael Paula Souza;
• João Alves Meira;
• Curso de Administração Hospitalar (1946-1947);
• Curso de Nutrição;
• Eris Focessi Lencastre
• Maria Cecília F. Pelicione;
• NACE-NUPESE (Núcleo de Promoção e Educação em Saúde Escolar);
• NISAM (Núcleo de Informações em Saúde Ambiental);
• SUS – documentos de instituição
• América Latina e Caribe
• Movimento Constitucionalista de 1932