O logotipo do Centro de Memória da FSP-USP refere-se ao prédio da Faculdade de Saúde Pública – o antigo  Instituto de Higiene – com suas janelas abertas e em movimento. A ideia é expressar a criticidade do CM frente ao extenso corpo documental e suas representações. Se as janelas abertas buscam o diálogo com a sociedade e tensionam as interpretações sobre as fontes históricas, como os mitos de origem da Saúde Pública, desenhá-las em movimento, por sua vez, carrega a ideia de que a memória não é estática ou fixa, mas sim está em constante construção.