O laboratório de Microbiologia Ambiental e Resistência a Antimicrobianos (MicroRes) do Departamento de Saúde Ambiental da Faculdade de Saúde Pública/USP  tem como missão a avaliação da qualidade microbiológica e parasitológica de matrizes ambientais (água superficial e subterrânea, água de consumo humano, lodo de esgoto, esgoto tratado e bruto, água de reuso). Além das técnicas clássicas, também são aplicadas técnicas inovadoras de isolamento e identificação de patógenos no ambiente, bem como  técnicas moleculares aplicadas à sua identificação, na detecção de genes de resistência a antimicrobianos, de genes de virulência e identificação de genótipos de interesse em Saúde Pública. O laboratório MicroRes também tem como missão o desenvolvimento de habilidade prática e da análise crítica relacionada ao potencial de aplicação dos conhecimentos adquiridos nas atividades desenvolvidas pelos pesquisadores do departamento, estudantes de graduação, pós-graduação e de iniciação científica e na qualificação de profissionais.