Os docentes do Departamento de Epidemiologia orientam em cinco dos seis programas de pós-graduação stricto sensu.
O programa de Entomologia em Saúde Pública é coordenado pela Professora Associada Eunice Aparecida Bianchi Galati e o Programa de Epidemiologia é coordenado pela Professora Titular Maria Regina Alves Cardoso.